MedRodeoは膨大な収録文献数を誇るMEDLINEから目的に合わせて効率的に文献を絞り込みます。
MedRodeo は、MEDLINE 検索支援ソフトウエアです。MedRodeo データベースには、MEDLINE と前処理検索をしたデータが含まれており、文献検索した結果にどのようなタームが含まれているかを表示することができます。 |
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MedRodeo は、網羅性(如何に漏れがないか?)、操作性(如何に使いやすいか?)、拡張性(文献検索+αの実現)を追求したシステムです。
漏れのない網羅的な結果の取得が可能
MeRodeo は、MEDLINEから情報を抽出したMedRodeoデータベースを持っています。入力したQueryでMedRodeoデータベースを高速スキャンし、関連性のあるタームやそのタームが含まれる論文を網羅的に収集します。
検索文をラクラク作成
MedRodeoを用いれば複雑な検索条件文をクリックするだけで簡単に作成することができます。
単なる文献検索にとどまりません
MedRodeoと別売のBioINTEGRAとを連接することにより、文献検索の結果からの配列情報の取得・検索が可能になります。さらに将来的にはPathwayツールや特許情報との連携を予定。単なるMEDLINE検索にとどまりません。
もちろん、これら以外のユーザーニーズに応じたカスタマイズも可能。すべて自社開発だからこそ実現できるのです。
また辞書としてワールドフュージョン社製LSKBを辞書として搭載することも可能です。
検索エンジン
自社開発検索エンジンSeqDBを採用
スコアリング
スコアリング
最適化エンジン
最適化エンジン
検索結果を4つの特長的なViewで表示します。
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検索結果に含まれるタームをGene(遺伝子)、Disease(疾患)、Chemical(化合物)、Tissue(臓器)に分類し、頻度とスコアを加えて表示します。Cell Functionの把握に必要な生化学的情報や考察結果の吟味に必要な生化学的視点での情報を提供します。 |
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ヒットしたArticleをPMID順に表示します。 |
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検索結果に含まれるMeSHを頻度とスコアを加えて表示します。 |
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検索結果から抽出されたタームの関連語を簡単に検索できます。 |
MedRodeo 辞書内の検索が可能です。
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オプション機能の一部をご紹介します。
LSKB(ワールドフュージョン社製)搭載
MedRodeo は従来の文献検索システムとは異なる新しいタイプの分析型文献検索システムです。
検索操作繰り返しによる文献絞込みを通じて、文献に記載されている遺伝子、疾患、化合物および組織の関連を分析する能力を備えています。
網羅性や即時性に関しては、デファクトスタンダードな文献検索システムである米国NLM PubMedと同等であり、かつ、文献解析ツールや知識ベースシステムが持つ情報の純度や検索精度を併せ持った画期的なシステムです。
MedRodeo により、必要な文献を早く探し出すことができ、かつ、抽出されたキーワードを閲覧することで概要を理解することができます。
分類 | 製品/サービス名 | 網羅性 | 純度 | 即時性 | 精度 | 拡張性 | 特徴 |
文献検索型 (古典的) |
NLM PubMed | ◎ | × | ◎ | × | × | ライフサイエンス文献のデファクト |
解析ツール型 | 米国R社文献解析ツール | × | ○ | × | ◎ | × | 共起抽出用学習データ搭載 |
知識ベース型 | 米国I社知識データベース | × | ◎ | × | ◎ | × | 専門家が文献を解読して遺伝子・タンパク・疾患関連をDB化 |
文献検索型 (分析的) |
MSS MedRodeo | ◎ | ○ | ◎ | ○ | ○ | [分析機能] GDCT分析、選択的なスコアリング [精度、即時性] 遺伝子辞書搭載(MeSH+EntrezGene) デイリーアップデート |
OS | RedHat Enterprise Linux 3以降 |
CPU | Intel Xeon 2.4GHz Dual以上 |
メモリ | 2GB以上 |
HDD | 300GB以上 |
DBMS | SeqDB(当社製)、PostgreSQL |
Webブラウザー | Netscape6以降、Internet Explorer 5.5以降 |