MedRodeoは膨大な収録文献数を誇るMEDLINEから目的に合わせて効率的に文献を絞り込みます。

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MedRodeo

MedRodeo は、MEDLINE 検索支援ソフトウエアです。MedRodeo データベースには、MEDLINE と前処理検索をしたデータが含まれており、文献検索した結果にどのようなタームが含まれているかを表示することができます。
MEDLINE データベースには、膨大な数の文献が登録されており、目的の文献にいち早くたどり着く為には、適切なクエリーを組み立てえる必要があります。MedRodeo は、検索結果に含まれるタームを頻度やスコアと共に表示することで、次のクエリーを組み立てる為のヒントを提供します。
また、Gene(遺伝子)、Disease(疾患)、Chemical(化合物)、Tissue(臓器)の関係を一覧で表示することで、新しい研究・発見の手助けをします。

MedRodeo
活用事例紹介

特長 (Features)

MedRodeo は、網羅性(如何に漏れがないか?)、操作性(如何に使いやすいか?)、拡張性(文献検索+αの実現)を追求したシステムです。

MeRodeo=網羅性+操作性+拡張性 網羅性 操作性 拡張性

網羅性

漏れのない網羅的な結果の取得が可能
MeRodeo は、MEDLINEから情報を抽出したMedRodeoデータベースを持っています。入力したQueryでMedRodeoデータベースを高速スキャンし、関連性のあるタームやそのタームが含まれる論文を網羅的に収集します。

網羅性
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操作性

検索文をラクラク作成
MedRodeoを用いれば複雑な検索条件文をクリックするだけで簡単に作成することができます。

操作性 ~検索文をラクラク作成
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拡張性

単なる文献検索にとどまりません
MedRodeoと別売のBioINTEGRAとを連接することにより、文献検索の結果からの配列情報の取得・検索が可能になります。さらに将来的にはPathwayツールや特許情報との連携を予定。単なるMEDLINE検索にとどまりません。
もちろん、これら以外のユーザーニーズに応じたカスタマイズも可能。すべて自社開発だからこそ実現できるのです。
また辞書としてワールドフュージョン社製LSKBを辞書として搭載することも可能です。

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機能説明 (Tech. Spec)

基本機能

検索エンジン
自社開発検索エンジンSeqDBを採用

スコアリング
スコアリング

最適化エンジン
最適化エンジン

View

検索結果を4つの特長的なViewで表示します。

GDCT View
GDCT View

検索結果に含まれるタームをGene(遺伝子)、Disease(疾患)、Chemical(化合物)、Tissue(臓器)に分類し、頻度とスコアを加えて表示します。Cell Functionの把握に必要な生化学的情報や考察結果の吟味に必要な生化学的視点での情報を提供します。

Article View
Article View

ヒットしたArticleをPMID順に表示します。
ごく一般的なViewです。

MeSH View
MeSH View

検索結果に含まれるMeSHを頻度とスコアを加えて表示します。

Neighbor View
Neighbor View

検索結果から抽出されたタームの関連語を簡単に検索できます。
関連語は、全MEDLINEにおける共起頻度に基づき検索します。

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辞書検索

MedRodeo 辞書内の検索が可能です。

Synonym検索
Synonym検索画面イメージ
Scope Note検索
Scope Note検索画面イメージ
遺伝子リスト検索
遺伝子リスト検索画面イメージ
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オプション

オプション機能の一部をご紹介します。
LSKB(ワールドフュージョン社製)搭載

オプション LSKB(ワールドフュージョン社製)搭載
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PubMedとの比較

MedRodeo は従来の文献検索システムとは異なる新しいタイプの分析型文献検索システムです。
検索操作繰り返しによる文献絞込みを通じて、文献に記載されている遺伝子、疾患、化合物および組織の関連を分析する能力を備えています。
網羅性や即時性に関しては、デファクトスタンダードな文献検索システムである米国NLM PubMedと同等であり、かつ、文献解析ツールや知識ベースシステムが持つ情報の純度や検索精度を併せ持った画期的なシステムです。

MedRodeo により、必要な文献を早く探し出すことができ、かつ、抽出されたキーワードを閲覧することで概要を理解することができます。

分類 製品/サービス名 網羅性 純度 即時性 精度 拡張性 特徴
文献検索型
(古典的)
NLM PubMed × × × ライフサイエンス文献のデファクト
解析ツール型 米国R社文献解析ツール × × × 共起抽出用学習データ搭載
知識ベース型 米国I社知識データベース × × × 専門家が文献を解読して遺伝子・タンパク・疾患関連をDB化
文献検索型
(分析的)
MSS MedRodeo [分析機能]
GDCT分析、選択的なスコアリング
[精度、即時性]
遺伝子辞書搭載(MeSH+EntrezGene)
デイリーアップデート
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推奨環境 (Sys. Req.)


OS RedHat Enterprise Linux 3以降
CPU Intel Xeon 2.4GHz Dual以上
メモリ 2GB以上
HDD 300GB以上
DBMS SeqDB(当社製)、PostgreSQL
Webブラウザー Netscape6以降、Internet Explorer 5.5以降
その他のOSに関してはお問い合わせください。
お問い合わせ
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